Membro do GDMA desenvolve pipeline para análise de RNA-Seq
Postado em 08/abr/2019
O estudante de doutorado em Zootecnia e membro do GDMA, Haniel Cedraz (foto), juntamente com o pesquisador da Embrapa Suinos e Aves, Mauricio Cantão, desenvolveram um pipeline para análise de RNA-Seq.
O BAQCOM é um projeto que visa desenvolver pipelines de fácil execução para análises de bioinformática. Atualmente o BAQCOM apresenta dois pipelines automatizados para análise de RNA-Seq usando Trimmomatic para Controle de Qualidade e STAR para mapeamento dos transcritos. Estes pipelines diminuem consideravelmente o tempo para realização das análises de RNA-Seq, sendo capazes de executar amostras em paralelo aumentando a eficiência computacional.